Séminaire Mireille BETERMIER

redacteur — 2011-06-22T07:10:16Z

Jeudi 8 mars 2012 - 11h00 Amphi « CURIE »

Mireille BETERMIER Centre de Génétique Moléculaire, Gif sur Yvette

Dynamique du génome chez la paramécie : Cassures programmées de l'ADN et leur réparation.

Bien qu'unicellulaire, la paramécie possède deux types de noyaux qui coexistent dans le même cytoplasme, illustrant ainsi la séparation physique entre les fonctions somatiques (expression des gènes) et germinales (transmission à la descendance sexuelle) du génome. A chaque cycle sexuel, un nouveau noyau somatique (macronoyau ou MAC) se différencie à partir du noyau germinal. Pendant le développement du MAC, des dizaines de milliers de courtes séquences non codantes, les IES (Internal Eliminated Sequences), s'excisent précisément du génome somatique, ce qui conduit à l'assemblage des gènes fonctionnels. Ces réarrangements programmés du génome font intervenir l'introduction de cassures double-brin aux bornes des IES. Nos résultats récents ont montré la participation d'une transposase domestiquée, PiggyMac, dans cette étape de coupure de l'ADN. Dans des cellules déplétées pour PiggyMac, de nouveaux MAC peuvent se former, mais ceux-ci ne sont pas fonctionnels du fait de la rétention des IES dans les gènes, ce qui provoque la mort de la descendance sexuelle. Le séquençage haut débit de l'ADN génomique extrait de cellules inactivées pour l'expression de PiggyMac nous a permis d'identifier 45,000 IESs et de confirmer leur très courte taille (93% sont <150 bp). Leur distribution de taille présente une périodicité remarquable qui coïncide avec le pas de la double hélice d'ADN. Cette observation est en accord avec l'hypothèse d'une interaction entre les deux extrémités de chaque IES avant l'étape de coupure, via la formation d'une boucle d'ADN double-brin. Nous avons également montré que deux protéines-clés de la voie NHEJ (Non homologous End Joining) de réparation des cassures double-brin, la ligase IV et son partenaire Xrcc4, sont essentielles pour la réparation des sites d'excision et la circularisation des IES. Nos travaux actuels visent à comprendre la façon dont se fait le couplage entre la coupure de l'ADN et la réparation des cassures aux sites d'excision des IES.

Laboratoire de Biochimie - UMR 7654

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